deletions | additions       diff --git a/bibliography/.placeholder.md b/bibliography/.placeholder.md  new file mode 100644  index 0000000..3cb958d  --- /dev/null  +++ b/bibliography/.placeholder.md 
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{\fancyplain{}{\textsl{\thepage}}}  \begin{center}  {\LARGE Relatório Científico de Andamento}   \end{center}  \begin{description}  \item[Título do Projeto:] Ferramentas do Detetive Ecológico: uso e avaliação de modelos com detecção imperfeita  \item[Responsável:] Paulo Inácio de Knegt López de Prado  \item[Instituição-sede:] Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo  \item[Equipe Executora]{\bf:}  \begin{itemize}  \item Carlos Ernesto Candia-Gallardo, Pós-graduação em Ecologia IB--USP  \item Leonardo Liberali Wedekin, Pós-doutorado IB--USP  \item Rodolpho Credo Rodrigues, Pós-graduação em Ecologia IB--USP  \item Karlla Barbosa dos Santos, Bolsista TT-III  \item Melina de Souza Leite, Especialista em Laboratório, IB--USP  \end{itemize}  \item[Processo:] 2013/19250-7 Auxílio Pesquisa - Regular   \item[Vigência:] 01/02/2014 a 31/01/2016   \item[Período deste relatório:] 01/02/2014 a 30/01/2015  \end{description}  diff --git a/figures/.placeholder.md b/figures/.placeholder.md  new file mode 100644  index 0000000..3cb958d  --- /dev/null  +++ b/figures/.placeholder.md 
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\newcommand{\R}{{\sf R}}  \newcommand{\code}[1]{\texttt{#1}}  \renewcommand{\footrulewidth}{0.5pt}  diff --git a/layout.md b/layout.md  new file mode 100644  index 0000000..0e71c30  --- /dev/null  +++ b/layout.md 
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fancyplaintextslthep.tex  sectionResumo_do_pro.tex  sectionResultados_do.tex  sectionConcluses_PI.tex  sectionApoio_institu.tex  sectionAplicao_da_RT.tex  sectionProduo_no_per.tex  diff --git a/preamble.tex b/preamble.tex  new file mode 100644  index 0000000..98415ea  --- /dev/null  +++ b/preamble.tex 
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\documentclass{article}  \usepackage{amsfonts,amsmath,amssymb}  \usepackage{graphicx}  \usepackage{color}  \usepackage{url}  \bibliographystyle{plain}  diff --git a/sectionAplicao_da_RT.tex b/sectionAplicao_da_RT.tex  new file mode 100644  index 0000000..fdc1565  --- /dev/null  +++ b/sectionAplicao_da_RT.tex 
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\section{Aplicação da RT e benefícios complementares} %PI  diff --git a/sectionApoio_institu.tex b/sectionApoio_institu.tex  new file mode 100644  index 0000000..1011034  --- /dev/null  +++ b/sectionApoio_institu.tex 
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\section{Apoio institucional} %PI  Recebi todo o apoio institucional necessário, que foi detalhado no formulário de infraestrutura institucional,   encaminhado com o termo de outorga.  diff --git a/sectionConcluses_PI.tex b/sectionConcluses_PI.tex  new file mode 100644  index 0000000..fdf56d7  --- /dev/null  +++ b/sectionConcluses_PI.tex 
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\section{Conclusões} %PI  diff --git a/sectionProduo_no_per.tex b/sectionProduo_no_per.tex  new file mode 100644  index 0000000..02d0296  --- /dev/null  +++ b/sectionProduo_no_per.tex 
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\section{Produção no período} % Todos  As instruções da FAPESP para relatórios científicos solicitam a lista de publicações resultantes do projeto no período.  Assim, informo que, entre as modalidades de publicação indicadas nas instruções, foi produzida   \subsection{Trabalhos preparados} % todos  Também conforme as instruções da FAPESP, incluo esta seção.   De acordo com as instruções, anexei uma cópia dos manuscritos a este relatório.  diff --git a/sectionResultados_do.tex b/sectionResultados_do.tex  new file mode 100644  index 0000000..a6d1b59  --- /dev/null  +++ b/sectionResultados_do.tex 
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\section{Resultados do período}  \subsection{Borboletas: dinâmica de comunidades e neutralidade} %Kiwi  \label{sec:dinamica-temporal-borb}   \subsection{Aves: complexidade de habitats e diversidade} % Rodolpho  \label{sec:compl-de-habit}   \subsection{Baleias: dinâmica populacional e flutuações climáticas} % Leo  \label{sec:dinam-popul-de}   \subsection{Síntese: sensibilidade à detecção imperfeita} % PI  diff --git a/sectionResumo_do_pro.tex b/sectionResumo_do_pro.tex  new file mode 100644  index 0000000..971e68f  --- /dev/null  +++ b/sectionResumo_do_pro.tex 
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\section{Resumo do projeto}  \subsection{Contexto e objetivo geral}  \label{sec:contexto}   O desenvolvimento e aplicação de teoria ecológica depende de estimativas  não-enviesadas e precisas da ocorrência, tamanho e taxas vitais de  populações naturais. Há uma percepção crescente de que  tais estimativas são fortemente afetadas por erros de observação, dos  quais as falsas ausências são o exemplo mais óbvio. Assim, o  pressuposto de detecção perfeita ou invariável de espécies e  indivíduos em sido fortemente questionado, bem como os resultados que  dele derivam. Em resposta a esse problema desenvolveu-se um formalismo  de modelos estatísticos que separa dois níveis de  variação dos dados: a camada de observação e a camada do processo  biológico. Os modelos hierárquicos com detecção  imperfeita são resultado desse formalismo. Têm implementações  computacionais acessíveis a ecólogos, e podem ser aplicadas em muito  mais casos do que têm sido. Por outro lado, essa nova abordagem  envolve procedimentos estatísticos mais complexos e um maior esforço  de amostragem. Assim, é necessário avaliar os ganhos efetivos dos  modelos com detecção imperfeita em diferentes tipos de pesquisas  ecológicas. O objetivo desta proposta é usar estimativas de  ocorrência, abundância e taxas vitais de espécies obtidos com modelos  de detecção imperfeita em três estudos de casos que juntos abrangem  testes sobre estrutura e dinâmicas de populações e comunidades, em  aspectos teóricos e aplicados. Além da importância teórica e aplicada  dos estudos de caso em si, vamos avaliar a sensibilidade dos  resultados e conclusões à adoção da abordagem de modelos com detecção  imperfeita.  \subsection{Objetivos específicos}  \label{sec:especificos}   \begin{enumerate}  \item Testar se mudanças temporais na abundância relativa e  diversidade de borboletas nectarívoras de subosque   são condizentes com previsões da Teoria Neutra ou com  previsões de modelos baseados em nicho.   \item Investigar se a correlações entre a diversidade de estratos da  vegetação e diversidade de aves de cerrado é explicada pelos padrões  de uso e sobreposição de uso desses estratos pelas aves.  \item Investigar os efeitos de flutuações climáticas a nível global na  dinâmica populacional das baleias-jubarte que usam as águas  brasileiras como área de reprodução.  \item Avaliar o impacto do uso das estimativas com detecção imperfeita  sobre as conclusões obtidas no três estudos de caso acima.  \end{enumerate}  diff --git a/title.tex b/title.tex  new file mode 100644  index 0000000..7111dc9  --- /dev/null  +++ b/title.tex 
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No Title Found  diff --git a/untitled.tex b/untitled.tex  new file mode 100644  index 0000000..a2e0039  --- /dev/null  +++ b/untitled.tex 
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