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\documentclass[12pt, A4]{article}  \usepackage[english,brazil]{babel}  \usepackage[utf8]{inputenc}  \usepackage[T1]{fontenc}  \usepackage{natbib}  \usepackage{url}  \usepackage{graphicx}  \usepackage{fancyhdr,multicol}  \usepackage[paper=a4paper, textwidth=5.5in, top=1in, bottom=1.25in, headheight=.5in, headsep=0.5in, footskip=0.5in]{geometry}  % \setlength{\hoffset}{-0.5in}  % \setlength{\textwidth}{6in}  % \setlength{\voffset}{-0.1in}  % \setlength{\textheight}{10in}  % \setlength{\parindent}{0pt}  \pdfpagewidth=\paperwidth  \pdfpageheight=\paperheight  \setlength{\parskip}{1ex plus 0.5ex minus 0.2ex} % espaco entre paragrafos e retira tabulacao no inicio  \newcommand{\R}{{\sf R}}  \newcommand{\code}[1]{\texttt{#1}}  \renewcommand{\footrulewidth}{0.5pt}  \begin{document}  %\maketitle  \pagestyle{fancyplain}  \lhead[] {\textsl{\footnotesize } \\ \textsl{\footnotesize Relatório Proc. FAPESP 2013/19250--7}}  \rhead[\fancyplain{}{\textsl{\thepage}}]%  {\fancyplain{}{\textsl{\thepage}}}  \rfoot[]{\textsl{\footnotesize Laboratório de Ecologia Teórica -- IBUSP} \\  \footnotesize \url{http://ecologia.ib.usp.br/let}}  \lfoot[]{}  \cfoot[]{}  \thispagestyle{empty}  %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%  %\vspace{-10in}  \begin{center}  {\LARGE Relatório Científico de Andamento}   \end{center}  \begin{description}  \item[Título do Projeto:] Ferramentas do Detetive Ecológico: uso e avaliação de modelos com detecção imperfeita  \item[Responsável:] Paulo Inácio de Knegt López de Prado  \item[Instituição-sede:] Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo  \item[Equipe Executora]{\bf:}  \begin{itemize}  \item Carlos Ernesto Candia-Gallardo, Pós-graduação em Ecologia IB--USP  \item Leonardo Liberali Wedekin, Pós-doutorado IB--USP  \item Rodolpho Credo Rodrigues, Pós-graduação em Ecologia IB--USP  \item Karlla Barbosa dos Santos, Bolsista TT-III  \item Melina de Souza Leite, Especialista em Laboratório, IB--USP  \end{itemize}  \item[Processo:] 2013/19250-7 Auxílio Pesquisa - Regular   \item[Vigência:] 01/02/2014 a 31/01/2016   \item[Período deste relatório:] 01/02/2014 a 30/01/2015  \end{description}  \section{Resumo do projeto}  \subsection{Contexto e objetivo geral}  \label{sec:contexto}  O desenvolvimento e aplicação de teoria ecológica depende de estimativas  não-enviesadas e precisas da ocorrência, tamanho e taxas vitais de  populações naturais. Há uma percepção crescente de que  tais estimativas são fortemente afetadas por erros de observação, dos  quais as falsas ausências são o exemplo mais óbvio. Assim, o  pressuposto de detecção perfeita ou invariável de espécies e  indivíduos em sido fortemente questionado, bem como os resultados que  dele derivam. Em resposta a esse problema desenvolveu-se um formalismo  de modelos estatísticos que separa dois níveis de  variação dos dados: a camada de observação e a camada do processo  biológico. Os modelos hierárquicos com detecção  imperfeita são resultado desse formalismo. Têm implementações  computacionais acessíveis a ecólogos, e podem ser aplicadas em muito  mais casos do que têm sido. Por outro lado, essa nova abordagem  envolve procedimentos estatísticos mais complexos e um maior esforço  de amostragem. Assim, é necessário avaliar os ganhos efetivos dos  modelos com detecção imperfeita em diferentes tipos de pesquisas  ecológicas. O objetivo desta proposta é usar estimativas de  ocorrência, abundância e taxas vitais de espécies obtidos com modelos  de detecção imperfeita em três estudos de casos que juntos abrangem  testes sobre estrutura e dinâmicas de populações e comunidades, em  aspectos teóricos e aplicados. Além da importância teórica e aplicada  dos estudos de caso em si, vamos avaliar a sensibilidade dos  resultados e conclusões à adoção da abordagem de modelos com detecção  imperfeita.  \subsection{Objetivos específicos}  \label{sec:especificos}  \begin{enumerate}  \item Testar se mudanças temporais na abundância relativa e  diversidade de borboletas nectarívoras de subosque   são condizentes com previsões da Teoria Neutra ou com  previsões de modelos baseados em nicho.   \item Investigar se a correlações entre a diversidade de estratos da  vegetação e diversidade de aves de cerrado é explicada pelos padrões  de uso e sobreposição de uso desses estratos pelas aves.  \item Investigar os efeitos de flutuações climáticas a nível global na  dinâmica populacional das baleias-jubarte que usam as águas  brasileiras como área de reprodução.  \item Avaliar o impacto do uso das estimativas com detecção imperfeita  sobre as conclusões obtidas no três estudos de caso acima.  \end{enumerate}  \section{Resultados do período}  % Cada seção descrever brevemente:  % 1- Resumo das atividades de coleta de dados realizadas (descrição  % breve das viagens/coletas e o resultado geral de cada uma, uma  % tabela de resumo dos dados obtidos até o momento).   % 2 - Mudanças de metodologia e/ou no cronograma, justificadas  % 3 - Mudanças e acréscimos de objetivos, com justificativa  % 4 - Próximos passos, com referência explícita ao previsto no cronograma  % 5 - outras observações que julgar pertinentes  \subsection{Borboletas: dinâmica de comunidades e neutralidade} %Kiwi  \label{sec:dinamica-temporal-borb}  %% Kiwi: pode ater-se à pergunta original deste projeto, mesmo que em  %% seu doutorado estejamos em mudança. Os dados permitem testar a  %% hipótese original e por ora creio que basta mostrar que estamos  %% coletando-os adequadamente. O resultado parcial que pode ser  %% adiantado é a comparação das taxas demográficas entre as diversas espécies.  \subsection{Aves: complexidade de habitats e diversidade} % Rodolpho  \label{sec:compl-de-habit}  %% Descrição das atividades do piloto  %% Descrição do delineamento amostral  %% Resumo dos dados coletados até ao momento: um resumo que indique  %% que a densidade de registros é suficiente para responder às perguntas  \subsection{Baleias: dinâmica populacional e flutuações climáticas} % Leo  \label{sec:dinam-popul-de}  %% Além dos resultados e análise já realizados, indicar rede de  %% colaborações estabelecidas e como se articulam com o projeto.  \subsection{Síntese: sensibilidade à detecção imperfeita} % PI  \section{Conclusões} %PI  \section{Apoio institucional} %PI  Recebi todo o apoio institucional necessário, que foi detalhado no formulário de infraestrutura institucional,   encaminhado com o termo de outorga.   \section{Aplicação da RT e benefícios complementares} %PI  % Utilizei a maior parte da reserva técnica e benefícios complementares na adequação do laboratório que recebi  % de meu departamento. Foram necessárias mudanças de instalação, remoção de bancadas e aquisição de mobiliário  % para torná-lo um ambiente adequado ao trabalho teórico e computacional. Antes de realizar estes   % gastos, consultei o canal \emph{``Converse com a FAPESP''}, e recebi autorização.   % Usei uma pequena fração da reserva técnica para comprar uma mochila para \emph{notebook},  % e cerca de R\$3.150,00 em mais um \emph{notebook} para a equipe.  \section{Produção no período} % Todos  %indiquem se houve algum artigo, comunicação em congresso, etc  As instruções da FAPESP para relatórios científicos solicitam a lista de publicações resultantes do projeto no período.  Assim, informo que, entre as modalidades de publicação indicadas nas instruções, foi produzida   \subsection{Trabalhos preparados} % todos  %% Manuscritos em preparação derivados od projeto: indicar aqui e  %% enviar cópia a mim ou incluí-la no GitHub  Também conforme as instruções da FAPESP, incluo esta seção.   De acordo com as instruções, anexei uma cópia dos manuscritos a este relatório.  \bibliographystyle{ecol_let}  \end{document}