Jenna M. Lang deleted file Table 8: PCR primer constructs used for Illumina MiSeq library preparation.md  over 9 years ago

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#Table 2: PCR primer constructs used for Illumina MiSeq library preparation  | Name | Illumina adapter sequence | barcode | pad | linker | primer | Complete Oligo |  |---------------|-------------------------------|----------|-------------|--------|----------------------|-----------------------------------------------------------------------|  | 16S_515_bc1 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AACCAGTC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAACCAGTCTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc2 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AACGCTAA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAACGCTAATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc3 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AAGACTAC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAAGACTACTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc4 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AATCGATA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAATCGATATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc5 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ACCAATTG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACCAATTGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc6 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ACTGAAGT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACTGAAGTTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc7 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ATTGCCGC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACATTGCCGCTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc8 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CAACCTTA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCAACCTTATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc9 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CCTAATAA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCCTAATAATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc10 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CCTCTGAT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCCTCTGATTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc11 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CGGTCGAG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCGGTCGAGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc12 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CTAATGGC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCTAATGGCTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc13 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CTCATGCG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCTCATGCGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc14 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GAACGGAG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGAACGGAGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc15 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GCCTACGC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGCCTACGCTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc16 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GCGTTACC | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGCGTTACCTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc17 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGAGGCTG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGAGGCTGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc18 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGATGCCA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGATGCCATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc19 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGATTAGG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGATTAGGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc20 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GTTGGCCG | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGTTGGCCGTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc21 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TATTAACT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTATTAACTTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc22 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TGACTGCT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTGACTGCTTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc23 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TGGCGATT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTGGCGATTTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc24 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TTCAGCGA | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTTCAGCGATATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_515_bc25 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TTGGCTAT | TATGGTAATTG | TG | TGCCAGCMGCCGCGGTAA | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTTGGCTATTATGGTAATTGTGTGCCAGCMGCCGCGGTAA |  | 16S_806R_bc1 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AACCAGTC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAACCAGTCAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc2 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AACGCTAA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAACGCTAAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc3 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AAGACTAC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAAGACTACAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc4 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | AATCGATA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACAATCGATAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc5 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ACCAATTG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACCAATTGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc6 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ACTGAAGT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACACTGAAGTAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc7 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | ATTGCCGC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACATTGCCGCAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc8 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CAACCTTA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCAACCTTAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc9 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CCTAATAA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCCTAATAAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc10 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CCTCTGAT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCCTCTGATAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc11 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CGGTCGAG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCGGTCGAGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc12 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CTAATGGC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCTAATGGCAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc13 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | CTCATGCG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACCTCATGCGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc14 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GAACGGAG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGAACGGAGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc15 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GCCTACGC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGCCTACGCAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc16 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GCGTTACC | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGCGTTACCAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc17 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGAGGCTG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGAGGCTGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc18 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGATGCCA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGATGCCAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc19 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GGATTAGG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGGATTAGGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc20 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | GTTGGCCG | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGTTGGCCGAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc21 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TATTAACT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTATTAACTAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc22 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TGACTGCT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTGACTGCTAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc23 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TGGCGATT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTGGCGATTAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc24 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TTCAGCGA | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTTCAGCGAAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |  | 16S_806R_bc25 | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC | TTGGCTAT | AGTCAGTCAG | CC | GGACTACHVGGGTWTCTAAT | AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTTGGCTATAGTCAGTCAGCCGGACTACHVGGGTWTCTAAT |