deletions | additions       diff --git a/figures/ordination_all1/scatter.ipynb b/figures/ordination_all1/scatter.ipynb  new file mode 100644  index 0000000..66f8cd4  --- /dev/null  +++ b/figures/ordination_all1/scatter.ipynb 
...
{  "metadata": {  "name": ""  },  "nbformat": 3,  "nbformat_minor": 0,  "worksheets": [  {  "cells": [  {  "cell_type": "raw",  "metadata": {},  "source": [  "This IPython Notebook contains simple examples of the scatter function. \n",  "\n",  "To clear all previously rendered cell outputs, select from the menu:\n",  "\n",  " Cell -> All Output -> Clear"  ]  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [  "import numpy as np\n",  "from bokeh.plotting import *"  ],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": [],  "prompt_number": 1  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [  "N = 100"  ],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": [],  "prompt_number": 2  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [  "x = np.linspace(0, 4*np.pi, N)\n",  "y = np.sin(x)"  ],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": [],  "prompt_number": 3  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [  "output_notebook()"  ],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": [  {  "html": [  "

\n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  "

Configuring embedded BokehJS mode.

\n",  " \n",  "

"  ],  "metadata": {},  "output_type": "display_data"  }  ],  "prompt_number": 4  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [  "scatter(x,y, color=\"#FF00FF\", tools=\"pan,zoom,resize\")\n",  "scatter(x,y, color=\"red\", tools=\"pan,zoom,resize\")\n",  "scatter(x,y, type=\"rect\", color=\"green\", tools=\"pan,zoom,resize\")\n",  "scatter(x,y, type=\"square\", color=\"blue\", tools=\"pan,zoom,resize\")"  ],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": [  {  "html": [  "

\n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  "

Plots

\n",  "\n",  " \n",  "

"  ],  "metadata": {},  "output_type": "display_data"  },  {  "html": [  "

\n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  "

Plots

\n",  "\n",  " \n",  "

"  ],  "metadata": {},  "output_type": "display_data"  },  {  "html": [  "

\n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  "

Plots

\n",  "\n",  " \n",  "

"  ],  "metadata": {},  "output_type": "display_data"  },  {  "html": [  "

\n",  " \n",  " \n",  " \n",  " \n",  "

Plots

\n",  "\n",  " \n",  "

"  ],  "metadata": {},  "output_type": "display_data"  },  {  "metadata": {},  "output_type": "pyout",  "prompt_number": 5,  "text": [  ""  ]  }  ],  "prompt_number": 5  },  {  "cell_type": "code",  "collapsed": false,  "input": [],  "language": "python",  "metadata": {},  "outputs": []  }  ],  "metadata": {}  }  ]  }