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La estructura general del PJA puede incluir varios niveles de criterio. Se suponga que en el ejemplo anterior la hermana gemela de Alonso, Mariana también fue aceptada con beca completa a las tres universidades. Los padres insisten a que asistan a la misma universidad. El problema implica ahora dos jerarquías, los valores de P y Q en la primera jerarquía son los pasos relativos que representan las opiniones de Alonso y Marina presumiblemente iguales. Los pesos: (P1 y P2) (Q1 y Q2). En la segunda jerarquía, representan las preferencias de Alonso y Mariana con respecto a la ubicación y reputación de cada universidad.